گروه مپنا از زمان ورود به حوزه حمل‌ونقل ریلی در نیمه دوم دهه 80، فعالیت‌های قابل‌توجهی در این بخش انجام داده است. ساخت 150 دستگاه لوکوموتیو دیزل الکتریک و طراحی و تولید لوکوموتیو باری MAP24 از پروژه‌های تأثیرگذار مپنا در این زمینه محسوب می‌شوند. فعالیت‌های جاری در توسعه راه آهن شهری (مترو) و پروژه تراموای اصفهان از پروژه‌های در دست اجرا هستند که اشتراک‌هایی با حوزه کسب‌وکارهای جدید نیز دارند و در راستای بهبود کیفیت حمل‌ و نقل شهری و کاهش آلودگی طراحی شده‌اند. توسعه پروژه‎‌های سرمایه‌گذاری مثل تشکیل شرکت توسعه ناوگان ریلی مپنا به عنوان یکی از کلیدی‌ترین مؤلفه‌های حضور مپنا در زمینه حمل و نقل ریلی است.
مپنا در حال حاضر با ایجاد کنسرسیوم های توانمند برای اجرای پروژه ها، تامین خدمات مهندسی و تامین و تجهیز طرح‌ها ، همچنین همکاری با شرکت‌های مطرح اروپایی و آسیایی به یکی از قدرت‌های صنعت ریلی کشور تبدیل شده است. عقد قرارداد اجرای پروژه متروی اصفهان، عقد قرارداد پروژه متروی کرج و اجرای پروژه تامین توان خط ۳ متروی تهران پروژه‌های جاری مپنا در حوزه ریلی هستند.
از آنجا که بخش حمل و نقل، یکی از بزرگترین مصرف‌کنندگان فرآورده‌های نفتی است و سهم ۴۰ درصدی در مصرف این انرژی دارد، تغییر شیوه‌های سنتی حمل و نقل و ارائه راهکارهایی که منجر به صر‌فه جویی در مصرف انرژی و کاهش آلودگی‌های زیست‌محیطی می‌شوند از دغدغه‌های گروه مپنا در سال‌های اخیر است. گروه مپنا در همین راستا در سال 1395 مسئولیت اجرای بخشی از پروژه خط 6 مترو تهران را برعهده گرفت. پروژه مونوریل قم و خط 3 مترو اصفهان از دیگر پروژه‌های مپنا در زمینه توسعه خطوط قطار شهری هستند.
کاهش آلودگی هوا، کاهش مصرف سوخت و بالا بودن ایمنی راه‌های ریلی_ برقی باعث شده تا برقی کردن سیستم ریلی، مورد توجه مسئولان قرار بگیرد. تغییر راه‌آهن سنتی به راه‌آهن مدرن و برقی همچنین باعث بازدهی بیشتر و سود کلان نهایی برای کشور خواهد شد. گروه مپنا با در دست داشتن نیروهای متخصص و کارآمد و تجهیزات پیشرفته این امکان را فراهم می‌کند تا راه‌های ریلی قدیمی را به شیوه‌های نوین به راه‌آهن برقی تبدیل کند.
گروه مپنا با در نظر گرفتن اهداف بلند مدت در توسعه سیستم‌های حمل و نقل ریلی، تامین قطار را نیز به انجام می‌رساند. این گروه با وجود چالش‌های عمده‌ای که در توسعه زیرساخت‌های صنعت ریلی وجود دارد، نشان ملی خود را در این صنعت ثبت و با شرکت‌های معتبر اروپایی و آسیایی همکاری می‌کند. یکی دیگر از توانمندی‌های شرکت گروه مپنا، توان ارائه خدمات در زمینه حمل بار و مسافر و تامین قطار است.